V roku 1985 sa Scooby-Doo, Shaggy, Scrapy-Doo a mladý podvodník Flim Flam spojili s renomovaným kúzelníkom a čarodejníkom Vincentom Van Peerom v seriáli Scooby-Doo a 13 duchov – dvanásť z nich premohli, ale trinásty im unikol a teraz sa po takmer troch desiatkach rokov vracia. A síce v okamihu, keď sa Záhady s. r. o. rozhodnú ukončiť svoju činnosť po tom, čo zadržia nesprávneho páchateľa a miestny šerif im pohrozí, že by mohli tiež čoskoro skončiť vo väzení, ak ich niekto obviní z obťažovania, pretože budú čoskoro plnoletí. Partia usporiada garážový výpredaj vecí, ktoré nazhromaždila počas svojej detektívnej kariéry, ale keď dôjde na starú krištáľovú guľu, skontaktuje ich prostredníctvom nej Van Peer a lov na trinásteho ducha menom Asmodeus sa začína.